MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 34689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	308183797
2	NC_014560	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	308183797
3	NC_014560	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183797
4	NC_014560	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	308183797
5	NC_014560	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183797
6	NC_014560	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	308183797
7	NC_014560	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	308183797
8	NC_014560	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183797
9	NC_014560	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	308183797
10	NC_014560	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183798
11	NC_014560	TTA	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183798
12	NC_014560	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	308183798
13	NC_014560	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183798
14	NC_014560	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	308183798
15	NC_014560	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183798
16	NC_014560	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	308183798
17	NC_014560	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183798
18	NC_014560	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308183798
19	NC_014560	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	308183799
20	NC_014560	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183799
21	NC_014560	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183799
22	NC_014560	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183799
23	NC_014560	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183799
24	NC_014560	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183799
25	NC_014560	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	308183799
26	NC_014560	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	308183799
27	NC_014560	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	308183799
28	NC_014560	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183799
29	NC_014560	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183799
30	NC_014560	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	308183799
31	NC_014560	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	308183799
32	NC_014560	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183799
33	NC_014560	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183799
34	NC_014560	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183800
35	NC_014560	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	308183800
36	NC_014560	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	308183800
37	NC_014560	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	308183800
38	NC_014560	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	308183800
39	NC_014560	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183800
40	NC_014560	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	308183800
41	NC_014560	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183800
42	NC_014560	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183800
43	NC_014560	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	308183800
44	NC_014560	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183800
45	NC_014560	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183800
46	NC_014560	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183800
47	NC_014560	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	308183800
48	NC_014560	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183800
49	NC_014560	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183800
50	NC_014560	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308183800
51	NC_014560	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	308183800
52	NC_014560	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	308183800
53	NC_014560	GTTT	2	8	2427	2434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014560	TG	3	6	2520	2525	0 %	50 %	50 %	0 %	308183801
55	NC_014560	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	308183801
56	NC_014560	T	7	7	2559	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	308183801
57	NC_014560	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	308183801
58	NC_014560	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	308183801
59	NC_014560	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183801
60	NC_014560	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	308183801
61	NC_014560	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	308183801
62	NC_014560	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	308183801
63	NC_014560	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183801
64	NC_014560	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183801
65	NC_014560	AAG	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183801
66	NC_014560	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183801
67	NC_014560	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	308183802
68	NC_014560	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	308183802
69	NC_014560	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	308183802
70	NC_014560	GGT	2	6	3577	3582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183802
71	NC_014560	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183802
72	NC_014560	GCGATA	2	12	3726	3737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308183802
73	NC_014560	AGAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	308183802
74	NC_014560	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	308183802
75	NC_014560	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183802
76	NC_014560	TGT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183802
77	NC_014560	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183802
78	NC_014560	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014560	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014560	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014560	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014560	TGG	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014560	GTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014560	ACC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014560	GGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014560	T	8	8	4596	4603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014560	AAT	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014560	AAC	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014560	TAA	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014560	TTA	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014560	T	7	7	4827	4833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014560	A	6	6	4838	4843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014560	A	6	6	4854	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014560	TGT	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014560	GTTT	2	8	4916	4923	0 %	75 %	25 %	0 %	308183803
96	NC_014560	TC	3	6	4977	4982	0 %	50 %	0 %	50 %	308183803
97	NC_014560	T	7	7	5017	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	308183803
98	NC_014560	GCTT	2	8	5034	5041	0 %	50 %	25 %	25 %	308183803
99	NC_014560	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183804
100	NC_014560	A	6	6	5068	5073	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
101	NC_014560	C	8	8	5098	5105	0 %	0 %	0 %	100 %	308183804
102	NC_014560	A	7	7	5106	5112	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
103	NC_014560	A	6	6	5123	5128	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
104	NC_014560	CAAA	2	8	5137	5144	75 %	0 %	0 %	25 %	308183804
105	NC_014560	CAAAA	2	10	5150	5159	80 %	0 %	0 %	20 %	308183804
106	NC_014560	A	7	7	5165	5171	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
107	NC_014560	A	8	8	5180	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
108	NC_014560	A	6	6	5196	5201	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
109	NC_014560	A	8	8	5212	5219	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
110	NC_014560	A	6	6	5226	5231	100 %	0 %	0 %	0 %	308183804
111	NC_014560	A	9	9	5237	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
112	NC_014560	A	6	6	5256	5261	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
113	NC_014560	CAAA	2	8	5269	5276	75 %	0 %	0 %	25 %	308183805
114	NC_014560	ACCC	2	8	5290	5297	25 %	0 %	0 %	75 %	308183805
115	NC_014560	A	6	6	5298	5303	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
116	NC_014560	A	6	6	5312	5317	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
117	NC_014560	A	8	8	5328	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
118	NC_014560	A	6	6	5342	5347	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
119	NC_014560	A	6	6	5353	5358	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
120	NC_014560	A	7	7	5370	5376	100 %	0 %	0 %	0 %	308183805
121	NC_014560	TCGC	2	8	5532	5539	0 %	25 %	25 %	50 %	308183806
122	NC_014560	CATT	2	8	5605	5612	25 %	50 %	0 %	25 %	308183806
123	NC_014560	ATT	2	6	5627	5632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183806
124	NC_014560	TGG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183806
125	NC_014560	A	6	6	5837	5842	100 %	0 %	0 %	0 %	308183806
126	NC_014560	CTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183806
127	NC_014560	T	6	6	5869	5874	0 %	100 %	0 %	0 %	308183806
128	NC_014560	A	6	6	5879	5884	100 %	0 %	0 %	0 %	308183806
129	NC_014560	TTG	2	6	5928	5933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183806
130	NC_014560	TAA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183806
131	NC_014560	TTA	2	6	6054	6059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183806
132	NC_014560	GTG	2	6	6123	6128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183806
133	NC_014560	GTT	2	6	6143	6148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183806
134	NC_014560	GC	3	6	6185	6190	0 %	0 %	50 %	50 %	308183806
135	NC_014560	CAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183806
136	NC_014560	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183806
137	NC_014560	GCC	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183806
138	NC_014560	T	6	6	6395	6400	0 %	100 %	0 %	0 %	308183806
139	NC_014560	GCTTGC	2	12	6429	6440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183806
140	NC_014560	CAG	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183806
141	NC_014560	GCG	2	6	6502	6507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183806
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273	NC_014560	A	7	7	12238	12244	100 %	0 %	0 %	0 %	308183811
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